Сегодня российский научный сектор испытывает острую нехватку квалифицированных кадров. В связи с этим Университет «Синергия» активизирует силы и интегрирует опыт ведущих научных деятелей и специалистов с высшими научными степенями - профессоров, докторов наук - для создания наиболее благоприятных условий для развития научной деятельности и раскрытия потенциала молодых и амбициозных разработчиков и исследователей.
В стенах Университета «Синергия» студенты и молодые специалисты получают уникальную возможность – принять участие в научной деятельности ведущих специалистов: присоединиться к реализации проекта, проведению исследования в рамках широкого спектра отраслей науки – от разработки инновационных средств защиты информационных сетей до создания универсального компьютерного дизайна, максимальным образом удовлетворяющего потребности пользователей. Для этих целей в Университете работает бизнес-инкубатор «Синергия», где студенты получают профессиональные советы по совершенствованию собственных проектов.
Деятельность венчурной фабрики Университета направлена на помощь в реализации проектов (финансовое обеспечение), Центр коммерциализации технологий содействует внедрению проектов молодых разработчиков на российский и международный рынок, привлечению зарубежных инвесторов и общественности к инновационным путям решения актуальных вопросов.
На территории Университета также действуют два Диссертационных совета, в которых выпускники Университета и других вузов успешно осуществляют защиту диссертаций на соискание ученой степени доктора и кандидата экономических наук, Центр экономических исследований решает задачи по привлечению молодых специалистов к такому направлению научной деятельности, как профессиональный анализ экономической ситуации и тенденций рынка.
Широкая сеть международных и деловых контактов позволяет Университету совершенствовать научную деятельность и по такому направлению, как участие в крупнейших научных и научно-практических конференциях и исследованиях иностранных коллег.